隨著二代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，精準(zhǔn)醫(yī)療行業(yè)的興起，個(gè)體化用藥、生物大數(shù)據(jù)、基因組學(xué)等概念快速形成產(chǎn)業(yè)，在不斷摸索和積累中成長(zhǎng)。
對(duì)于“精準(zhǔn)醫(yī)療”，有人看好，有人唱衰。這條“精準(zhǔn)”之路究竟有多難走，如何才能走的長(zhǎng)遠(yuǎn)而堅(jiān)實(shí)，今天我們采訪(fǎng)了中科院基因組所研究員胡松年教授，請(qǐng)跟隨我們傾聽(tīng)胡教授的觀點(diǎn)。
胡教授：早期我就是主要做組學(xué)，從和華大一起參與人類(lèi)基因組計(jì)劃開(kāi)始，一直做相關(guān)的研究工作。但這兩年我們的工作重心開(kāi)始偏臨床應(yīng)用方向了：首先政策層面講，從國(guó)家到我們?cè)豪?，都希望科研人員更多的去做應(yīng)用性研究，而我們本身也希望多做一些和老百姓生活健康更切實(shí)相關(guān)的應(yīng)用性工作。所以這兩年的研究項(xiàng)目逐步調(diào)整到更多去和醫(yī)院、醫(yī)生來(lái)合作，做一些疾病相關(guān)的基因組分析。
隨著二代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，精準(zhǔn)醫(yī)療行業(yè)的興起，也會(huì)有來(lái)找到我們合作項(xiàng)目的企業(yè)。我們會(huì)選擇有自主研發(fā)實(shí)力的企業(yè)進(jìn)行深入合作，合作企業(yè)的產(chǎn)品或數(shù)據(jù)一定要有可信性、穩(wěn)定性、持續(xù)性等特質(zhì)，因?yàn)榭蒲腥藛T是很注重細(xì)節(jié)的，對(duì)合作企業(yè)要求會(huì)很高。
比如現(xiàn)在我們和益序醫(yī)療合作的“高血壓精準(zhǔn)用藥基因隊(duì)列項(xiàng)目”，企業(yè)方自身具備二代測(cè)序的核心專(zhuān)利技術(shù)和平臺(tái)，而我們的優(yōu)勢(shì)是模型設(shè)計(jì)和生信分析，來(lái)與企業(yè)和市場(chǎng)共同打造高血壓專(zhuān)項(xiàng)數(shù)據(jù)庫(kù)。
目前整體的項(xiàng)目合作都很順利，即便是在項(xiàng)目研發(fā)的過(guò)程中偶爾出現(xiàn)些問(wèn)題，也能就產(chǎn)品優(yōu)化等問(wèn)題與益序公司有比較順暢的溝通和高效的協(xié)作。對(duì)此，組里的同仁也都非常認(rèn)可，自然會(huì)投入較多的精力在這個(gè)項(xiàng)目上。
另外，從培養(yǎng)學(xué)生的角度講，我也希望讓他們能更早地體驗(yàn)到，科研工作如何真正落地來(lái)和企業(yè)合作的這種需求和效率，在工作難度上是很有挑戰(zhàn)的。同時(shí)讓他們看到自己的科研成果的轉(zhuǎn)化應(yīng)用和市場(chǎng)前景時(shí)，也會(huì)增加他們學(xué)習(xí)和研究的樂(lè)趣。
轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)：現(xiàn)在很多測(cè)序企業(yè)都在做
腫瘤靶向用
藥方面的產(chǎn)品，而高血壓屬于慢病，貌似不是“精準(zhǔn)醫(yī)療”的主流方向，您是如何鎖定高血壓這個(gè)細(xì)分領(lǐng)域的呢？您能談?wù)剝烧叩牟町惷矗?/div>
不同個(gè)體對(duì)藥物的敏感性是有差異的
胡教授：之所以關(guān)注高血壓，首先是因?yàn)槲冶旧砭褪歉哐獕夯颊?，而且有過(guò)非常明顯的用藥不適應(yīng)癥經(jīng)歷，所謂不痛不動(dòng)嘛！最開(kāi)始我吃硝苯地平的副作用非常嚴(yán)重，渾身肌肉酸痛；后來(lái)經(jīng)過(guò)一段時(shí)間的調(diào)藥過(guò)程，換成絡(luò)活喜后，馬上又沒(méi)事了。事實(shí)上，雖然這兩種藥在高血壓五大類(lèi)藥物的分類(lèi)上屬于同一類(lèi)型，但人體內(nèi)負(fù)責(zé)代謝的酶和基因多態(tài)性相互作用的關(guān)系，卻造成了這種個(gè)體用藥反應(yīng)上的表型差異；
其次，從臨床意義上講，目前90%左右的西藥在做藥物研發(fā)時(shí)，其相關(guān)藥物代謝的研究脈絡(luò)是比較清楚的，所以要想做個(gè)體化精準(zhǔn)醫(yī)療，用藥反應(yīng)比明確病因更容易入手。
另外，從醫(yī)生的角度考慮，即便患者查出了基因的問(wèn)題，但到臨床上卻沒(méi)有對(duì)應(yīng)的治療和用藥方案，那這樣不僅不能解決問(wèn)題，反而會(huì)增加醫(yī)生的負(fù)擔(dān)。
最后，從藥物層面講，我們對(duì)于大多數(shù)進(jìn)口西藥的經(jīng)驗(yàn)不多，臨床應(yīng)用就要從嘗試和探索起步。有醫(yī)生跟我講過(guò)伊立替康的例子，這種藥的副作用是嚴(yán)重的腹瀉，就出現(xiàn)過(guò)患者因?yàn)楦弊饔盟涝隈R桶上的。如此嚴(yán)重的副反應(yīng)，如果用藥之前能了解個(gè)體之間的差異，通過(guò)劑量的調(diào)整，或?qū)ふ移渌幬锏奶娲桨?，就可以避免或減輕這樣的問(wèn)題。
因此，我們目前和企業(yè)合作的這個(gè)“高血壓精準(zhǔn)用藥”的測(cè)序項(xiàng)目，就是想從藥物代謝入手，是可以給臨床醫(yī)生一些提示和參考的。幫助醫(yī)生了解患者的藥物代謝水平，梳理不同藥物的劑量選擇，就可以在多種治療方案中選擇相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)小且更對(duì)癥的方案。即避免給醫(yī)生造成困惑，也可以讓病人減輕痛苦，提高療效和依從性，不至延誤病情。
這正是組學(xué)數(shù)據(jù)在臨床應(yīng)用中慢病優(yōu)于腫瘤的方面。
轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)：您在構(gòu)建數(shù)據(jù)庫(kù)的工作過(guò)程中，遇到哪些問(wèn)題和挑戰(zhàn)呢？
胡教授：目前對(duì)于中國(guó)人群來(lái)講，我們實(shí)在缺少垂直病種的基礎(chǔ)大數(shù)據(jù)，從基因多態(tài)性和突變頻率方面都是缺乏的。我們國(guó)家本身情況復(fù)雜，南方人和北方人，不同民族之間，在基礎(chǔ)頻率上都有差異。而目前絕大多數(shù)公司是基于歐美人群數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)選擇位點(diǎn)，這樣的簡(jiǎn)單照搬是有風(fēng)險(xiǎn)的。
比如我們以前做藥物代謝，其中腫瘤藥物伊立替康，在國(guó)內(nèi)患者中能發(fā)現(xiàn)弱代謝的類(lèi)型，而歐美人群是沒(méi)有的。但有些國(guó)外要求檢測(cè)的位點(diǎn)，在中國(guó)又是沒(méi)有頻率的。針對(duì)這個(gè)問(wèn)題，建立屬于中國(guó)人自己的數(shù)據(jù)庫(kù)顯得尤為重要，如果單純照搬復(fù)制不屬于中國(guó)人的頻率，檢測(cè)結(jié)果的可信度有多少？又會(huì)漏掉多少有問(wèn)題的位點(diǎn)？
轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)：這個(gè)問(wèn)題應(yīng)該是很多公司都面臨的問(wèn)題，您是如何解決的呢？
建立中國(guó)人自己的數(shù)據(jù)庫(kù)的價(jià)值和意義
從長(zhǎng)遠(yuǎn)來(lái)看，我們一定要拿到中國(guó)人群的一手?jǐn)?shù)據(jù)，就需要從測(cè)序入手，需要打造一個(gè)能長(zhǎng)期運(yùn)作、持續(xù)積累的項(xiàng)目堅(jiān)持下去，來(lái)分析中國(guó)人的基因型和高血壓相關(guān)藥物代謝之間的關(guān)聯(lián)性和個(gè)體差異。
這樣做下去，成本是很高，但到最后我們能沉淀下來(lái)的，是最終建立起中國(guó)人的高血壓組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)，描繪出中國(guó)的高血壓基因地圖，這其中的社會(huì)意義和商業(yè)價(jià)值是不可估量、不可取代的。
其次，如果只是單純的基因數(shù)據(jù)的累計(jì)，并不能產(chǎn)生很大價(jià)值，需要相匹配的表型數(shù)據(jù)和臨床資料。這就意味著，想要建立一個(gè)垂直領(lǐng)域的組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)，其中有巨量的工作需要做：
一方面，藥物代謝相關(guān)的知識(shí)結(jié)構(gòu)是動(dòng)態(tài)的，需要長(zhǎng)期跟蹤，組學(xué)數(shù)據(jù)的特點(diǎn)是需要反復(fù)更新、挖掘及整理，并且需要持續(xù)而有效地與表型數(shù)據(jù)相關(guān)聯(lián)；
另一方面，與患者生活、習(xí)慣及環(huán)境等相關(guān)的基本信息，也需要系統(tǒng)化的隨訪(fǎng)手段進(jìn)行收集和反饋。綜合這些信息，才能形成具有信息挖掘和分析價(jià)值的數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)。
我們很高興找到和自己大方向的研究目標(biāo)很貼切的合作伙伴，此次推出的“高血壓基因隊(duì)列數(shù)據(jù)庫(kù)”項(xiàng)目，通過(guò)商業(yè)化的市場(chǎng)運(yùn)作，才有可能不斷累計(jì)最新的樣本和更全的數(shù)據(jù)，我們共同鎖定了一個(gè)非常長(zhǎng)遠(yuǎn)的目標(biāo)：三年內(nèi)十萬(wàn)人免費(fèi)檢測(cè)，百萬(wàn)人入組隨訪(fǎng)，千萬(wàn)人臨床收益。因?yàn)橹挥挟?dāng)我們掌握了一定規(guī)模的中國(guó)人群數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)一定的中國(guó)人群特有的頻率，才能進(jìn)一步設(shè)計(jì)出在臨床應(yīng)用上既快速又低成本且指示性強(qiáng)的檢測(cè)方案，才更有普適性。
轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)：隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，將產(chǎn)出大量而龐雜的生物數(shù)據(jù)。您有一個(gè)研究領(lǐng)域是關(guān)于二代測(cè)序的數(shù)據(jù)產(chǎn)出和數(shù)據(jù)管理平臺(tái)的構(gòu)建，您能介紹平臺(tái)構(gòu)建方面的布局么？
胡教授：我們已經(jīng)建立二代測(cè)序大數(shù)據(jù)中心，將臨床的電子化數(shù)據(jù)和基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析，形成系統(tǒng)的統(tǒng)計(jì)模型，給臨床醫(yī)生一個(gè)可直接應(yīng)用的庫(kù)。
接下來(lái)我們?cè)诟哐獕侯I(lǐng)域的數(shù)據(jù)建設(shè)，計(jì)劃會(huì)分成不同層次：比如科學(xué)上總會(huì)有新的位點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)，這需要時(shí)時(shí)更新進(jìn)來(lái)，數(shù)據(jù)庫(kù)這一層次的職能是服務(wù)于科研人員的，他們需要對(duì)更新的位點(diǎn)進(jìn)行分析研究；另一個(gè)層次是開(kāi)放給臨床醫(yī)生的端口，做到把測(cè)序數(shù)據(jù)和用藥數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)起來(lái)，形成醫(yī)生可以直接提取的方案，提高醫(yī)療效率，降低醫(yī)療成本；再有就是病人層面的，要做到服務(wù)內(nèi)容更個(gè)性化、兼具科普性與實(shí)用性，指導(dǎo)人們健康生活。
最后，可以預(yù)見(jiàn)的是，揭示并理解“人體與疾病、疾病與藥物、藥物與機(jī)體代謝”之間的關(guān)聯(lián)性與作用機(jī)理，或許將是實(shí)現(xiàn)“以人為本”個(gè)性化治療的必要前提。二代測(cè)序技術(shù)的快速發(fā)展與組學(xué)研究的持續(xù)開(kāi)展，或?qū)⒊蔀槲覀兾磥?lái)做好個(gè)體化精準(zhǔn)治療的必要途徑。
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