近幾年來,隨著精準醫(yī)學(xué)概念的推進,基因檢測技術(shù)當下備受人們的推崇,它就像給人體做了一個詳細的說明書。然而,由于做基因檢測的實驗室繁多,關(guān)于基因突變的重新分類并沒有一套完整的系統(tǒng)或規(guī)范,不同實驗室對突變的術(shù)語命名體系也不同,基因檢測領(lǐng)域內(nèi)部還存在不少問題。
日前,美國《紐約時報》對該話題進行了深入的研究和報道。
報道稱,基因檢測出來的結(jié)果看似是一錘定音——基因存在突變或不存在,該突變會增加某疾病風險,或不增加。但事實上,這些發(fā)現(xiàn)并非看上去的那樣簡單直接,結(jié)果也可能會對病患們造成嚴重影響。
雖然一個人的基因組不會怎么變化,但研究中和疾病相關(guān)的某個DNA片段很多都處于不斷變化之中?;?qū)W家和基因測試實驗室不斷地收到新信息,使得其可以對基因突變進行重新評估和分類。
因此,今天看起來可能為良性的突變,明天有可能就會變得十分兇險,反之亦然。但目前還沒有一種好的方式令醫(yī)生和病患獲得更新后的消息。
這造成的結(jié)果便是:你幾年前測試過的基因,如今可能已完全變成另外一個結(jié)果。當然,這樣的問題只影響少數(shù)病人,其中大多數(shù)有不尋常的基因突變。更為常見的導(dǎo)致疾病的突變——比如那些會預(yù)測你可能患乳腺癌或結(jié)腸癌的突變——已經(jīng)被深入地研究過,因此它們的含義通常不需要再質(zhì)疑。
實驗報告只是一次性結(jié)果
據(jù)美國《紐約時報》報道,在最近的一項研究中,一家診斷性公司Myriad遺傳學(xué)公司的研究人員,對過去2006年至2016年間曾做過基因測試的145萬病人的數(shù)據(jù)進行了重新評估,以查看這些原始報告中的結(jié)果是否屬實。
實驗室對其中的6萬名患者發(fā)布了新的基因測試報告,這意味著舊版結(jié)果已經(jīng)完全被新數(shù)據(jù)所取代。但攜帶有被重新分類的突變基因的許多病患,仍被蒙在鼓里。美國貝勒醫(yī)學(xué)院的臨床遺傳專家莎倫·普隆醫(yī)生說道,“這個系統(tǒng)完全是一片混亂。”她說,現(xiàn)在根本沒有一套成系統(tǒng)的方式可以告知病人和醫(yī)生,以前被認為無害的突變?nèi)缃褚呀?jīng)顯示出有健康危害,或者以前人們認為危險的突變現(xiàn)在證實其實是良性的。
“部分實驗室報告的只是一次性的結(jié)果。”得克薩斯州西南醫(yī)學(xué)中心癌癥遺傳學(xué)項目主任羅斯醫(yī)生(TheodoraRoss)說道,“他們不會再去重新評估10年前的測試結(jié)果解釋方式,除非醫(yī)生們要求。”但醫(yī)生們幾乎不會過問,她補充說。
正常情況下,醫(yī)生會要求有嚴重家族病史的人進行基因測試,比如心臟病、中風或癌癥。病人血液或唾液樣本會被送到實驗室,其DNA會被掃描是否存在異常突變。
實驗室會將這些突變與此前科學(xué)研究中所顯示的可能導(dǎo)致疾病的突變進行對比。有些病人會被告知,他們的突變沒有多大意義。有些病人則會被告知,某個可疑基因存在“釋義原因不明的變種”,這意味著沒人知道該怎么辦。
還有部分病人出現(xiàn)看似危險的基因突變,意味著有很高風險可能患癌、心臟病或其他疾病。對這些病人來說,這樣的結(jié)果意味著需要定期檢測,會改變生活的一系列決定,包括是否生育等。
混亂的體系,各實驗室間難以調(diào)和
聯(lián)邦政府提供資金支持建立的數(shù)據(jù)庫ClinVar,可以讓實驗室之間分享基因突變數(shù)據(jù),以及他們認為這些突變的意義。但部分公司,比如Myriad,雖然儲存了關(guān)于基因突變的海量數(shù)據(jù),卻并沒有向ClinVar分享。
而即便是DNA變異的術(shù)語,也沒有被廣泛統(tǒng)一和分享。不同實驗室有著不同的命名體系。比如,ClinVar用這種方式表達其中一個DNA的變異:NM_004004.5(GJB2):c.101T>C(p.Met34Thr),而另外一家實驗室則是這樣表達:c.101T>C,p.Met34Thr,GJB2。麻省綜合醫(yī)院博德研究所的臨床遺傳學(xué)家HeidiRehm說道,病人自己搜索信息時“會不知道在ClinVar里輸入何種關(guān)鍵詞”。
除了術(shù)語問題外,羅斯醫(yī)生稱,實驗室之間也存在不可調(diào)和的問題。比如,當一家大型實驗室“報告了一種基因突變的重新分類方式,而其他實驗室卻還沒有,你的家庭成員們在不同實驗室做了檢測,那么對同一個病人的數(shù)據(jù)就會出現(xiàn)不同的解讀。”羅斯說道,“我們該如何解決?又該如何告知病人呢?”
像Myriad這樣的實驗室,往往會在突變基因信息被重新分類后通知醫(yī)生。但即便這樣,醫(yī)生也可能不會聯(lián)系和通知其病人。“我?guī)啄陜?nèi)換了幾個工作地點,而且有些病人已經(jīng)搬走了,”普隆醫(yī)生說,“比如有些病人已經(jīng)不在休斯頓住了,但我卻收到了他們更新后的醫(yī)院報告,我也不知道這些病人現(xiàn)在住在哪里。”
部分遺傳學(xué)家稱,需要得知更新后結(jié)果的病人往往是基因突變十分罕見的患者。他們不得不每年聯(lián)系醫(yī)生,詢問該突變的基因是否重新分類過,以及意味著什么。
突變信息的重新分類,讓他有更多打算
突變信息的重新分類,并非總是好消息。
達拉斯兒童醫(yī)療中心高級診斷實驗室臨床主任詹森·帕克博士稱,他曾告訴過一些患有嚴重癲癇兒童的父母,原本被認為是致病原因的基因突變其實是一種良性變化。
重新分類可能并不會改變治療,因為即便找到了被認為是導(dǎo)致嚴重癲癇的突變,往往也沒有具體的治療方式。但父母們認為,知道病因總歸比不知道好。“對這些家庭來說,這可能是很大的一個社會問題。”帕克博士說,“人們?yōu)槟硞€特定基因而聚到一起,形成支援小組。但現(xiàn)在他們不再屬于那個群體。”
但對居住在得克薩斯州的61歲消防員瑞克·蓋瑞森這樣的人來說,突變的重新分類可謂是一根救命稻草。
幾年前,他因為鼻子上長了一個疣而去看病,但一家病理實驗室在檢查該組織后注意到,他體內(nèi)和林奇綜合征(Lynchsyndrome)相關(guān)的蛋白質(zhì)出現(xiàn)異常變化,這種情況會導(dǎo)致多種癌癥的發(fā)生率陡增。他后來去羅斯博士及其遺傳學(xué)團隊那看病,后者將其血液樣本送去做林奇基因突變檢查。結(jié)果是:蓋瑞森的基因存在“釋義原因不明的變種”,而他的診斷也令人困惑:“類似林奇綜合征。”這意味著他得的有可能是這種病,也有可能不是。
醫(yī)生建議稱,他應(yīng)當每年都做結(jié)腸鏡檢查、內(nèi)窺鏡檢查以及全身皮膚檢查。但因為他的這種突變并非確定與林奇綜合征有關(guān),因此他的家人——他有5個孩子,都不用去做檢測以查看自己是否遺傳該疾病。
然而今年6月,實驗室再次聯(lián)系羅斯醫(yī)生,告知蓋瑞森的這種突變不再被劃分為“釋義原因不明的變異”,對其他病人的研究證實,該突變的確和林奇綜合征有關(guān)。一切都變了,他的孩子及直系親屬也必須做基因檢測,他該被定期監(jiān)測各種癌癥跡象。他原本計劃明年退休,但計劃必須變了,因為他擔心自己若罹患得林奇綜合征,健康保險成本太高。他會繼續(xù)做好這份有保險的消防工作,等到65歲再退休,屆時可拿到美國國家老年人醫(yī)療保險。
“我或許最終還是會因為癌癥而死。”蓋瑞森說,“但因為這些檢測,我可能還能多活幾年。”
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