2017年7月28日,“2017醫(yī)療IT創(chuàng)新研討會暨醫(yī)療大數(shù)據(jù)發(fā)展論壇”在云南省腫瘤醫(yī)院召開。陸軍軍醫(yī)大學(xué)西南醫(yī)院信息科汪鵬主任圍繞醫(yī)療大數(shù)據(jù)臨床應(yīng)用發(fā)表了精彩演講,從“醫(yī)療大數(shù)據(jù)正逢其時、百家爭鳴之靈感觸動、臨床輔診之探幽索勝、醫(yī)學(xué)智能之未來簡史”這四個方面,全面闡述了醫(yī)療大數(shù)據(jù)的基本內(nèi)涵、創(chuàng)新需求、發(fā)展現(xiàn)狀、建設(shè)實踐和未來動向,以期為我國醫(yī)療大數(shù)據(jù)的研發(fā)應(yīng)用提供些許借鑒。
汪鵬
陸軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院
(重慶西南醫(yī)院)
如何跳出傳統(tǒng)IT思維,去推動和輔助臨床信息化創(chuàng)新?這是新一代醫(yī)療IT建設(shè)者們需要思考的問題。
醫(yī)院信息化經(jīng)過20年的快速發(fā)展,已經(jīng)進入一個高度信息化、數(shù)據(jù)化的時代。然而,我們的臨床醫(yī)生看病與20年前又有什么本質(zhì)區(qū)別呢?——從手寫到用鍵盤取而代之,甚至“忘了”手寫,這似乎是為數(shù)不多的變化。
能否利用最新科技改變傳統(tǒng)診療模式,給醫(yī)生和患者提供更多智能和幫助呢?我認為,醫(yī)療大數(shù)據(jù)是邁向“智能醫(yī)學(xué)”的必經(jīng)之路。傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)模式正在加速向5P醫(yī)學(xué)模式轉(zhuǎn)變,即預(yù)防性(Preventive)、預(yù)測性(Predictive)、個體化(Personalized)、參與性(Participatory)、精準(zhǔn)醫(yī)療(PrecisionMedicine)——整個醫(yī)療服務(wù)領(lǐng)域已經(jīng)步入數(shù)據(jù)驅(qū)動時代,醫(yī)療大數(shù)據(jù)就是精準(zhǔn)診療、智能診療的基礎(chǔ)。
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醫(yī)療大數(shù)據(jù)正逢其時
概念逐步落地
需求蓬勃發(fā)展
政府強力引導(dǎo)
2008年,Nature雜志出版??疊igData,“大數(shù)據(jù)”一詞正式登上科學(xué)舞臺,并迅速成為各領(lǐng)域研究熱點。
資料卡:定義大數(shù)據(jù)
國際數(shù)據(jù)公司IDC對大數(shù)據(jù)定義如下:一種新一代的數(shù)據(jù)集及其技術(shù)和架構(gòu),具備高效的捕捉、發(fā)現(xiàn)和分析能力,能夠經(jīng)濟地從類型復(fù)雜、數(shù)量龐大的數(shù)據(jù)中挖掘出價值。
然而,至今仍然有很多人認為大數(shù)據(jù)是炒作居多,仍沉浸在傳統(tǒng)思維中。特別是健康醫(yī)療大數(shù)據(jù),常被“詬病”為“不夠多、不夠大,根本談不上什么大數(shù)據(jù),更鮮少成熟應(yīng)用”。這主要是因為沒有看清傳統(tǒng)方法對新需求的力不從心,沒有看清健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)發(fā)展的巨大潛力和創(chuàng)造力。
對于大數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn),國家統(tǒng)計局給出的最新特征是“6V+1C”(見圖1),大數(shù)據(jù)是指無法以傳統(tǒng)方法進行抓取、管理、處理和利用的數(shù)據(jù)集合。來源于臨床病歷、健康檔案、基礎(chǔ)知識庫、臨床知識庫、參考文獻、個人健康數(shù)據(jù)、基因與組學(xué)數(shù)據(jù)的醫(yī)療場景數(shù)據(jù)和大數(shù)據(jù)相關(guān)技術(shù)深度結(jié)合,使新模式、新價值得以產(chǎn)生。
數(shù)據(jù)種類豐富、結(jié)構(gòu)復(fù)雜是醫(yī)療數(shù)據(jù)的顯著特點(圖2),有學(xué)者測算,電子健康檔案(EHRs)中有80%的數(shù)據(jù)是以非結(jié)構(gòu)化形式存儲的,通常都是自然語言處理/錄入。因此,需要對自然語言進行語義分析和數(shù)據(jù)特征提取。目前,這仍然是較難的一個技術(shù)點,特別是中文。
同時需要注意的是,生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)的增長規(guī)模和復(fù)雜程度超出想象——來看一組數(shù)據(jù)。
資料卡:大數(shù)據(jù)有多大
2015年,生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)研究產(chǎn)出科學(xué)數(shù)據(jù)保守估計已經(jīng)超過EB量級,相當(dāng)于五百萬個國家圖書館的信息量;
單個個體相關(guān)的組學(xué)數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)總和已經(jīng)超過400G,相當(dāng)于2000個國家圖書館的信息量。
生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)正以前所未有的方式推動生命科學(xué)與生物技術(shù)的進步,生命科學(xué)進入信息時代,通過數(shù)據(jù)鏈整合產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新鏈已經(jīng)成為國際競爭新的技術(shù)制高點。
大數(shù)據(jù)需求蓬勃增長,應(yīng)用前景廣闊,以下簡單歸納了一些面向不同對象的醫(yī)療大數(shù)據(jù)應(yīng)用需求。
面向醫(yī)生
提供不良反應(yīng)與差錯分析提醒、智能臨床輔助診療與治療、單病種大宗病例統(tǒng)計分析、治療方法與療效對比、最小有效治療分析、精準(zhǔn)診療與個性化治療、醫(yī)學(xué)影像學(xué)智能標(biāo)注與分析等。
面向患者
提供全生命周期的健康檔案、自我健康管理、健康狀態(tài)的預(yù)測與預(yù)警等。
面向研究人員
提供科研數(shù)據(jù)采集與分析、科研選題與科研發(fā)現(xiàn)、用藥分析與藥物研發(fā)等。
面向管理者
提供精細化管理決策支持、基于數(shù)據(jù)的模擬分析、病種與疾病譜分析、疾病與疫情監(jiān)測等。
雖然需求非常旺盛,但到目前為止,還鮮見能夠非常成熟的去實現(xiàn)這些需求,特別是投入臨床應(yīng)用的、讓醫(yī)生和患者都滿意的信息化產(chǎn)品。因此,我們信息人還有很多工作要做!
圖3醫(yī)療大數(shù)據(jù)應(yīng)用促進診療模式的變革
醫(yī)療大數(shù)據(jù)應(yīng)用將有利于促進診療模式的變革。20年前,醫(yī)生主要靠手寫;20年來,醫(yī)生逐漸擺脫紙筆,利用電腦開處方、寫病歷;5-10年后,我預(yù)測,醫(yī)生不再孤獨地“戰(zhàn)斗”,在他們的背后會有大數(shù)據(jù)、人工智能、云計算等IT資源提供強有力的知識外掛組件。
我國政府也越來越關(guān)注大數(shù)據(jù)的布局——
2015年,國務(wù)院印發(fā)《促進大數(shù)據(jù)發(fā)展行動綱要的通知》
2016年,發(fā)布《十三五規(guī)劃綱要》,實施國家大數(shù)據(jù)戰(zhàn)略
2016年,國務(wù)院辦公廳再發(fā)《關(guān)于促進和規(guī)范健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)應(yīng)用發(fā)展指導(dǎo)意見》——從戰(zhàn)略到具體實施,國家從各個層面來指導(dǎo)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)的發(fā)展和實施。
2017年7月20日,國務(wù)院印發(fā)了《新一代人工智能發(fā)展規(guī)劃》,其中有兩點涉及到了大健康產(chǎn)業(yè):一是關(guān)于智能醫(yī)療的;二是關(guān)于智能健康和養(yǎng)老的。規(guī)劃對全行業(yè)人工智能的發(fā)展進行了闡述,明確了我國新一代人工智能發(fā)展的“三步走”戰(zhàn)略目標(biāo),提出到2030年中國要達到國際領(lǐng)先地位。
國家這些政策和利好對企業(yè)來說是商機,對我們醫(yī)療IT建設(shè)者來說是方向和指導(dǎo)。因此,健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)的產(chǎn)業(yè)熱度會保持很長一段時間,有望向新興的人工智能產(chǎn)業(yè)邁出堅實的一步。
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百家爭鳴之靈感觸動
一枝獨秀不是春
百花齊放春滿園
資料卡:本節(jié)提及的企業(yè)/研究機構(gòu)
Google、微軟、法國高速基因組測序分析平臺、飛利浦、HealthNucleus、IBM、威斯康星大學(xué)麥迪遜威絲曼中心、中國科學(xué)院北京基因組研究所生命與健康大數(shù)據(jù)中心、清華大學(xué)數(shù)據(jù)科學(xué)研究院醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)研究中心、電子科技大學(xué)的健康大數(shù)據(jù)研究所、高血壓大數(shù)據(jù)聯(lián)合實驗室、春雨·中國科學(xué)院大學(xué)健康大數(shù)據(jù)聯(lián)合實驗室、貴州省大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)實驗室、上海精準(zhǔn)醫(yī)療大數(shù)據(jù)中心、中華精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)中心、醫(yī)渡云、柯林布瑞、樂九醫(yī)療、Airdoc、同濟CT“阿爾法狗”、華大基因、華西-希氏醫(yī)學(xué)人工智能研發(fā)中心
?。ㄗ髡邆渥ⅲ阂韵沦Y料均來自互聯(lián)網(wǎng)業(yè)界報道,部分資料為本人與相關(guān)廠商交流獲悉。)
首先來看一組全球醫(yī)療大數(shù)據(jù)臨床應(yīng)用方面的具體實踐
GoogleFluView
專攻搜索引擎的一些公司在掌握大數(shù)據(jù)資源方面具有得天獨厚的優(yōu)勢,他們可以基于這些數(shù)據(jù)挖掘很多應(yīng)用,如關(guān)注熱點、消費習(xí)慣等。Google公司的FluView,是一個基于大數(shù)據(jù)分析的跟蹤工具,對流感預(yù)測是非常好的一個案例,也是較早廣泛報道成功案例。FluView能夠接收并處理來自搜索用戶、醫(yī)生、醫(yī)院以及CDC實驗室的大量數(shù)據(jù),為流感疫情的蔓延提供一個清晰的圖像,進而幫助阻止流感疫情的蔓延。
微軟Azure云平臺
微軟Azure云平臺推廣大型、開放的基因組數(shù)據(jù)集1000基因組,為研究人員提供幫助,并與很多基因公司合作,打造基因組大數(shù)據(jù)分析平臺。
法國高速基因組測序分析平臺
法國開建2個高速基因組測序分析平臺,主攻癌癥、糖尿病、罕見病,平均每年能夠?qū)崿F(xiàn)對1.8萬個基因組的測序和解讀。同時,啟動基因組和個體化醫(yī)療項目,以提高國家醫(yī)療診斷和疾病預(yù)防能力為整體目標(biāo),預(yù)計在全國范圍內(nèi)建立12個基因測序平臺,2個國家數(shù)據(jù)中心。
飛利浦
飛利浦聯(lián)合威徹斯特醫(yī)學(xué)中心啟動精準(zhǔn)醫(yī)療計劃,IntelliSpace基因組學(xué)解決方案無縫銜接了來自多個數(shù)據(jù)源的數(shù)據(jù),將基因組學(xué)分析與患者臨床數(shù)據(jù)相整合。
HealthNucleus
HealthNucleus的全基因組健康管理服務(wù)提供全基因組測序、微生物組測序、代謝組學(xué)分析、臨床檢查和影像服務(wù),可通過用戶基因組與人類參考基因組進行比較,評估用戶的基因組。
IBMWatsonHealth
廣受關(guān)注的IBMWatsonHealth的認知系統(tǒng)能不斷地學(xué)習(xí)、訓(xùn)練、產(chǎn)生知識,與理解的對象產(chǎn)生互動。整個方案包括Watsonforoncology(腫瘤,lung,breast,colon/rectal等的治療方案)、Watsonclinicaltrialmatching(臨床方案匹配,識別患者相適應(yīng)的臨床方案)、Watsondiscoveryadvisor(醫(yī)學(xué)發(fā)現(xiàn),從海量醫(yī)學(xué)文獻獲得洞察力)、Watsongenomicsadvisor(基因,從DNA序列中獲得洞察力)、Analysisofmedicalimages(醫(yī)學(xué)影像分析)。
IBMWatson要做的不是“占有”數(shù)據(jù),而是通過提供平臺鼓勵用戶自己訓(xùn)練Watson——我認為這個思路是正確的?;贗BMWatson的醫(yī)療助理每秒可以閱讀數(shù)億頁資料,幫助醫(yī)務(wù)人員獲取數(shù)據(jù),這在之前是做不到的。
GoogleAI
GoogleAI進軍醫(yī)療,在一些類型的乳腺癌的病理識別準(zhǔn)確率上超過了醫(yī)生——病理學(xué)家花了整整30個小時,仔細分析了130張切片,準(zhǔn)確率為73.3%,而谷歌AI交出的答卷則是88.5%。
類似的基于圖像識別的應(yīng)用還很多,例如基于腦部MRI的白質(zhì)高信號灶分割、基于皮膚鏡照片的皮膚癌分類診斷、基于數(shù)字病理切片的乳腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移檢測、基于眼底照片的糖尿病性視網(wǎng)膜病變檢測等等。這些基于影像的分析診斷能夠成功,主要是因為影像學(xué)提供了足夠的規(guī)則,因此很容易做出大數(shù)據(jù)判別。
威斯康星大學(xué)麥迪遜威絲曼中心和威斯康星發(fā)現(xiàn)研究院
基于錄音也可以進行大數(shù)據(jù)診斷,這非常新穎。根據(jù)威斯康星大學(xué)麥迪遜威絲曼中心和威斯康星發(fā)現(xiàn)研究院的新研究,依靠5min的錄音就足以判斷某個人是否容易罹患與基因相關(guān)的遺傳性疾病。目前已經(jīng)可以準(zhǔn)確地識別個體的突變前期的脆弱的X染色體。
達芬奇手術(shù)機器人
可以輔助醫(yī)生做手術(shù)的手術(shù)機器人也是重要的一部分,它可以利用各種知識庫可以實現(xiàn)精準(zhǔn)診療。達芬奇手術(shù)機器人已經(jīng)成為全球最成功和應(yīng)用最廣的手術(shù)機器人。
國內(nèi)在大數(shù)據(jù)、精準(zhǔn)診療方向上也有很多布局和應(yīng)用
中國科學(xué)院北京基因組研究所生命與健康大數(shù)據(jù)中心
中國科學(xué)院北京基因組研究所生命與健康大數(shù)據(jù)中心建立了海量生物組學(xué)大數(shù)據(jù)儲存與分析體系,建設(shè)組學(xué)大數(shù)據(jù)應(yīng)用與共享平臺,已完成整合全球1700多個生物數(shù)據(jù)庫,國內(nèi)首個原始組學(xué)數(shù)據(jù)歸檔庫正式上線,目前正開展人群精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)信息庫、原始組學(xué)數(shù)據(jù)的共享平臺。
清華大學(xué)數(shù)據(jù)科學(xué)研究院醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)研究中心
清華大學(xué)數(shù)據(jù)科學(xué)研究院醫(yī)療健康大數(shù)據(jù)研究中心整合海量醫(yī)療健康大數(shù)據(jù),為公眾健康、臨床決策、政府決策提供支持;對臨床表型與生命組學(xué)數(shù)據(jù)進行整合分析,實現(xiàn)對腫瘤、慢性病、罕見病等高危疾病實現(xiàn)精準(zhǔn)預(yù)防、診斷和治療。
電子科技大學(xué)健康大數(shù)據(jù)研究所
電子科技大學(xué)健康大數(shù)據(jù)研究所已經(jīng)完成大數(shù)據(jù)分級診療監(jiān)測評估系統(tǒng),目前承擔(dān)著基于健康云的老年健康管理服務(wù)、面向醫(yī)療保險的大數(shù)據(jù)分析應(yīng)用、醫(yī)學(xué)數(shù)字影像唯一身份識別等科研任務(wù)。
高血壓大數(shù)據(jù)聯(lián)合實驗室
高血壓大數(shù)據(jù)聯(lián)合實驗室由中國科學(xué)技術(shù)信息研究所、北京同仁醫(yī)院、科學(xué)技術(shù)文獻出版社共同成立,正在打通院內(nèi)數(shù)據(jù),形成產(chǎn)、學(xué)、研融合的高血壓數(shù)據(jù)平臺、管理平臺,后期將面向全國形成高血壓數(shù)據(jù)共享、應(yīng)用、發(fā)布的數(shù)據(jù)支撐平臺。
春雨·中國科學(xué)院大學(xué)健康大數(shù)據(jù)聯(lián)合實驗室
春雨·中國科學(xué)院大學(xué)健康大數(shù)據(jù)聯(lián)合實驗室是國內(nèi)專注于健康大數(shù)據(jù)的專業(yè)實驗室,目標(biāo)是實現(xiàn)智能和自動化的慢病管理,根據(jù)用戶線上問診數(shù)據(jù),實現(xiàn)初步的智能化疾病診斷,目前已成型使用,正開展分析健康消費數(shù)據(jù),增加用戶用藥和治療經(jīng)濟性,降低醫(yī)保賠付率。
貴州省大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)實驗室
貴州省大數(shù)據(jù)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)實驗室由貴州省醫(yī)牽頭成立,通過醫(yī)學(xué)影像大數(shù)據(jù),形成人工智能醫(yī)療體系,正在開展3D醫(yī)學(xué)影像,以讓醫(yī)學(xué)生更加熟悉人體構(gòu)造,同時將影像設(shè)備結(jié)合大數(shù)據(jù)分析提供出了更精準(zhǔn)的診斷方式。
上海精準(zhǔn)醫(yī)療大數(shù)據(jù)中心
上海精準(zhǔn)醫(yī)療大數(shù)據(jù)中心由復(fù)旦大學(xué)、復(fù)旦大學(xué)各個附屬醫(yī)院、上海張江轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研發(fā)中心組成,已開展生物大數(shù)據(jù)開發(fā)與利用研究,建立標(biāo)準(zhǔn)化的食管癌患者臨床信息管理系統(tǒng),搭建了精準(zhǔn)醫(yī)療臨床決策支持系統(tǒng)。
中華精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)中心
中華精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)中心由復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院和華大基因聯(lián)合成立;通過基因大數(shù)據(jù),建立覆蓋生育健康、腫瘤預(yù)防、心腦血管、遺傳及感染等領(lǐng)域具有國際水平的基因組學(xué)研究和應(yīng)用中心。
醫(yī)渡云、柯林布瑞、樂九醫(yī)療等國內(nèi)醫(yī)療大數(shù)據(jù)企業(yè)
國內(nèi)的醫(yī)渡云、柯林布瑞、樂九醫(yī)療等醫(yī)療大數(shù)據(jù)企業(yè)率先在醫(yī)院推廣全數(shù)據(jù)搜索引擎,把醫(yī)院積累的海量數(shù)據(jù)資源盤活,使得臨床資料的精確查找達到秒級水平?;谛阅茏吭降尼t(yī)療大數(shù)據(jù)平臺,醫(yī)渡云等企業(yè)還在與醫(yī)院合作,利用其積累深厚的NLP和大數(shù)據(jù)平臺構(gòu)建技術(shù),共同探索面向臨床的知識推薦服務(wù)系統(tǒng)。
Airdoc
人工智能企業(yè)Airdoc的輔助診斷模型可以識別百萬級甚至更高數(shù)量級的醫(yī)學(xué)影像。如能夠通過多維度數(shù)據(jù)分析輔助診斷及疾病預(yù)測,通過對文本、影像等多模態(tài)海量數(shù)據(jù)的綜合挖掘,建立預(yù)測分析模型,進一步探索疾病分布演化規(guī)律;如醫(yī)學(xué)影像識別,已經(jīng)針對大腦、心血管、肺部、肝臟、骨骼健康領(lǐng)域研發(fā)出多個模型。
同濟CT“阿爾法狗”
還有同濟CT“阿爾法狗”,據(jù)稱5秒讀結(jié)果,閱片水平已經(jīng)接近主治醫(yī)師,對于三毫米以內(nèi)的小病灶,人肉眼很容易遺漏掉,但是它卻能夠識別出來,對肺結(jié)節(jié)的發(fā)現(xiàn)準(zhǔn)確率更是高達90%。
華大基因
華大基因通過基因測序預(yù)測破解疾病,通過搭建生物信息云平臺進行超大規(guī)模的全基因組關(guān)聯(lián)分析,可以進行母體腫瘤早期篩查,研究遺傳病的分子流行病的突變點頻譜分布。
華西-希氏醫(yī)學(xué)人工智能研發(fā)中心
就在7月27日,四川華西醫(yī)院的華西-希氏醫(yī)學(xué)人工智能研發(fā)中心經(jīng)過3個月研發(fā),已經(jīng)實現(xiàn)了人工智能對消化內(nèi)鏡圖片的秒級診斷,診斷準(zhǔn)確率達90%以上,有望于未來2-3年臨床應(yīng)用。
據(jù)報道顯示,該人工智能技術(shù)的研發(fā)過程分為數(shù)據(jù)篩選、消化病變歸類、AI模型數(shù)據(jù)訓(xùn)練和深度學(xué)習(xí)、模型測試調(diào)整及再訓(xùn)練等4階段,目前已對20萬份病例數(shù)據(jù)進行了深度學(xué)習(xí),對息肉、腫瘤、靜脈曲張的初期診斷準(zhǔn)確率分別達到了92.7%、93.9%和96.8%。
以上這些案例并不足以完整描繪整個醫(yī)療大數(shù)據(jù)發(fā)展現(xiàn)狀,但足以看出,無論是在國內(nèi)還是國外,大數(shù)據(jù)、精準(zhǔn)診療、人工智能都是一個重要的風(fēng)口上,這將是信息化發(fā)展到一定階段后產(chǎn)生質(zhì)變的關(guān)鍵時期,我們應(yīng)該迎難而上,隨著潮流來做一些有意義、能落地的工作。
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臨床輔診之探幽索勝
所有的理論法則都依賴于實踐法則
——德國哲學(xué)家費希特
依托于西南醫(yī)院豐富的數(shù)據(jù),我們結(jié)合醫(yī)院實際情況做了一些膚淺的工作。
資料卡:西南醫(yī)院的大數(shù)據(jù)有多大
以2016年為例,西南醫(yī)院門診量近400萬,20幾年來已經(jīng)積累了海量數(shù)據(jù),為大數(shù)據(jù)分析提供了基礎(chǔ)。目前醫(yī)院包括影像系統(tǒng)在內(nèi)有600T以上的豐富數(shù)據(jù)儲備,其中包含4123萬條醫(yī)療就診記錄,253萬份電子病歷文檔資料,80萬份標(biāo)準(zhǔn)化存儲的生物樣本,110萬份與沙區(qū)共享的居民電子健康檔案。
目前,我院開展了臨床數(shù)據(jù)中心與搜索引擎、遺傳基因檢測運算、臨床醫(yī)師評價體系、CDSS研究、生物樣本庫、結(jié)構(gòu)化電子病歷智能檢索、輔助管理決策支持、臨床??撇》N數(shù)據(jù)庫等八個方面的醫(yī)療數(shù)據(jù)研究與應(yīng)用。
利用醫(yī)學(xué)超算平臺進行大數(shù)據(jù)研究
圖4西南醫(yī)院腫瘤遺傳與基因組中心專家利用超算平臺系統(tǒng),該圖為基因在人類染色體上的位置
2015年,我院依托生物遺傳中心、腫瘤遺傳與基因組中心、感染科等,結(jié)合中科院重慶綠色智能技術(shù)研究院超級高性能計算平臺,以及中科院軟件所大數(shù)據(jù)分析技術(shù),通過基因數(shù)據(jù)分析、跟蹤、對比研究,建立了大數(shù)據(jù)基因測序平臺,服務(wù)于個體健康和人類基因組數(shù)據(jù)應(yīng)用。中科院曙光5000A超算平臺能滿足300萬億次浮點計算能力,完全能夠滿足各科室需求。經(jīng)過兩年多的應(yīng)用實踐,共處理、分析兩萬余份生物樣本,使用超算CPU超過近10000機時,為西南醫(yī)院的科研和臨床應(yīng)用提供了重要支撐。
基于Hadoop架構(gòu)的醫(yī)院醫(yī)療大數(shù)據(jù)基礎(chǔ)服務(wù)平臺
圖5基于Hadoop架構(gòu)的醫(yī)院醫(yī)療大數(shù)據(jù)基礎(chǔ)服務(wù)平臺
該平臺可完成數(shù)據(jù)收集、數(shù)據(jù)存儲、數(shù)據(jù)清洗等工作,醫(yī)院HIS、EMRS、LIS、PACS等醫(yī)療信息子系統(tǒng)的數(shù)據(jù)通過ETL、收集、清洗、歸一化等處理,為上層應(yīng)用服務(wù)提供準(zhǔn)確的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)支撐。
以乳腺癌治療為突破口的CDSS研究
圖6以乳腺癌治療為突破口進行CDSS的研究
根據(jù)近十年來乳腺癌臨床治療的發(fā)展和變化,我院乳腺中心姜軍教授提出一個創(chuàng)新理論,即最小有效治療,認為由于患者年齡、身體狀況、臨床分期、組織類型、分子分型等等不同,應(yīng)更多地進行個體化治療,減少盲目和不合理的治療。
這種“最小有效治療”理論能減少過度治療帶來的盲目診療、縮短住院時間,對患者而言,不良反應(yīng)和并發(fā)癥相對較少,也更加經(jīng)濟。而這需要對疾病診療的知識特征進行分析,以盡量貼近醫(yī)生思考、判別的思維方式,因此需要構(gòu)建依托醫(yī)療大數(shù)據(jù)的精準(zhǔn)診療方案智能指導(dǎo)系統(tǒng),即臨床診療決策支持系統(tǒng)。依托于該系統(tǒng)能夠輔助實施精準(zhǔn)診療,輔助醫(yī)生進行知識學(xué)習(xí)更新和臨床診療。該系統(tǒng)目前也已經(jīng)針對患者開發(fā)了信息采集、病情分析和診療決策功能,并提供了病例查詢和統(tǒng)計分析等功能。
醫(yī)院專享“百度”
如何才能充分挖掘醫(yī)院積累的千百萬份病歷數(shù)據(jù)?
如何才能提高醫(yī)生錄入科研及隨訪數(shù)據(jù)的效率?
如何形成以學(xué)科、病種為主題的醫(yī)學(xué)科研數(shù)據(jù)庫?
如何才能把臨床大數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化成臨床詢證知識系統(tǒng)?
如何把醫(yī)院數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為有價值、可促進學(xué)科發(fā)展的資產(chǎn)?
圖7西南醫(yī)院臨床大數(shù)據(jù)醫(yī)學(xué)科研搜索引擎
我們開發(fā)了基于科研數(shù)據(jù)中心的臨床科研信息系統(tǒng);開發(fā)了臨床科研信息平臺,嘗試著將歷史積累的病例數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為支撐學(xué)科長期發(fā)展的戰(zhàn)略信息資源;開發(fā)了醫(yī)院臨床大數(shù)據(jù)醫(yī)學(xué)科研搜索引擎,輸入關(guān)鍵字后,三秒內(nèi)可以遍歷全院臨床資料,顯示搜索結(jié)果;開發(fā)了單病種科研隨訪系統(tǒng);我們還嘗試著開展臨床詢證知識推送系統(tǒng)研究,與門診醫(yī)生站、住院工作站、個人/科室科研數(shù)據(jù)庫集成融合,讓臨床醫(yī)生在診療過程中即時使用醫(yī)院積累的數(shù)據(jù)知識,在臨床診療過程中做科研。
圖8正在開發(fā)中的醫(yī)生站臨床詢證知識推送系統(tǒng)
在我們與一批大數(shù)據(jù)公司的合作規(guī)劃中,將逐步完成診療線索、臨床知識庫、智能文獻助手、智能決策四期工程。整體設(shè)計思路是與醫(yī)生站緊密結(jié)合,以便通過醫(yī)生站即可獲取臨床輔助決策信息。我們力爭形成這樣的大數(shù)據(jù)產(chǎn)品:工具化、產(chǎn)品化,與醫(yī)生的日常工作平臺緊密嵌入,具備高度的實時性和方便性,具備自主學(xué)習(xí)和智能化能力。
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醫(yī)學(xué)智能之未來簡史
醫(yī)療大數(shù)據(jù)與醫(yī)學(xué)人工智能
是一場事關(guān)人類健康與生存的知識革命
最近有一部暢銷書叫《未來簡史》,我參照該書目錄的提法,描述一下醫(yī)療大數(shù)據(jù)的"未來簡史"。
第一章悠長的過往
1996年以前的漫長時期,醫(yī)院信息化絕大部分以財務(wù)系統(tǒng)為主,從DOS到桌面,從單機到網(wǎng)絡(luò),從同軸電纜到雙絞線,一切都是為了把錢收準(zhǔn)、把賬管好。
第二章全面信息化簡史
從1997-2012年是醫(yī)院信息化發(fā)展非??斓碾A段,圍繞電子病歷、質(zhì)量與效率管理等的各大系統(tǒng)陸續(xù)上線,并改變了醫(yī)生傳統(tǒng)的工作方式。
第三章傳統(tǒng)方式的終結(jié)
從2013年-2016年,隨著醫(yī)院數(shù)據(jù)積累越來越大、系統(tǒng)間的接口越來越多,傳統(tǒng)信息不斷堆砌的方法走向終結(jié),醫(yī)院信息系統(tǒng)在交互性、標(biāo)準(zhǔn)化等方面迫切需要更好的規(guī)劃設(shè)計和調(diào)整。
第四章未來第一次浪潮:從ESB、CDR走向開放互聯(lián)
從2015年-2020年,我們迎來了“未來第一次浪潮”,醫(yī)院信息化建設(shè)從ESB、CDR走向標(biāo)準(zhǔn)化的開放互聯(lián),將為大數(shù)據(jù)發(fā)展奠定基礎(chǔ)。
第五章未來第二次浪潮:基于云端大數(shù)據(jù)的臨床輔診
從2017年-2025年,我們將迎來“未來第二次浪潮”,基于云端大數(shù)據(jù)的輔助診療系統(tǒng)將在臨床工作中越來越深入的應(yīng)用。
第六章未來第三次浪潮:醫(yī)學(xué)人工智能的革命
從2020年-2030年,在“未來第三次浪潮”中,我們將迎來醫(yī)學(xué)人工智能的革命,計算機真的能代替醫(yī)生的很多工作。
第七章中國將如何
如果說從工業(yè)革命到信息革命,中國都處于落后與被動局面,那么在人工智能研發(fā)應(yīng)用領(lǐng)域,我們與國外基本是在一個起跑線上。我們必須抓住機遇,加大基礎(chǔ)研究和應(yīng)用研發(fā),10-15年后爭取成為人工智能研發(fā)與應(yīng)用的大國、強國。
在談醫(yī)學(xué)人工智能之前,讓我們再回顧一下人工智能的前世今生。
人工智能這一概念是在1956年的達特莫斯(Dartmouth)會議上首次提出的,這一學(xué)科的研究領(lǐng)域現(xiàn)在包括機器人、語言識別、圖像識別、自然語言處理和專家系統(tǒng)等。人工智能的發(fā)展經(jīng)歷了上世紀(jì)50-60年代的形成期、上世紀(jì)70年代的暗淡期、上世紀(jì)80-90年代的應(yīng)用期,在21世紀(jì)進入突飛猛進期,人工智能在語音、語義、圖像等方面的應(yīng)用日益廣泛成熟,引起了各國各大研究機構(gòu)的關(guān)注,紛紛布局人工智能醫(yī)療研究領(lǐng)域。
依托于計算機視覺技術(shù)、自然語言處理技術(shù)、語音識別技術(shù)、機器人技術(shù)、機器深度學(xué)習(xí)技術(shù)這五大人工智能核心技術(shù),在醫(yī)學(xué)人工智能領(lǐng)域,知識共享、更快的分析、更智能的學(xué)習(xí)、更聰明的機器人、更自然的互動,將是未來的發(fā)展趨勢。
在今后一段時間,我個人判斷,融合人工智能技術(shù)的醫(yī)療大數(shù)據(jù)應(yīng)用將深度嵌入臨床診療過程,主要有以下幾個方面的趨勢。
醫(yī)療大數(shù)據(jù)應(yīng)用從當(dāng)前的科研數(shù)據(jù)利用層面逐步進入到臨床診療過程輔助層面;
循證醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)、臨床指南、醫(yī)學(xué)文獻等豐富數(shù)據(jù)資源將共同服務(wù)于臨床診療過程;
醫(yī)生工作站平臺將會外掛越來越來的醫(yī)學(xué)知識庫為診療過程提供智能化支持;
基于大數(shù)據(jù)分析的人工智能有望取代如影像科、病理科等大部分單一識別性與分析性工作;
醫(yī)院管理可實現(xiàn)全時段、全領(lǐng)域、全維度“數(shù)據(jù)型優(yōu)化”。
在具體應(yīng)用層面,可輔助診斷疾病的虛擬助理、可輔助醫(yī)生看片的醫(yī)學(xué)影像人工智能、可大幅度降低藥物研發(fā)成本的虛擬藥物篩選及挖掘、以意念控制芯片的康復(fù)醫(yī)療、可識別和降低疾病風(fēng)險的健康管理、可優(yōu)化醫(yī)療服務(wù)流程和資源配置的醫(yī)院管理等等,都是未來值得關(guān)注的發(fā)展方向。
不過,在醫(yī)療的AI研究領(lǐng)域,長期以來的一個困難是缺乏高質(zhì)量干凈的有臨床標(biāo)注的數(shù)據(jù)。同時,醫(yī)學(xué)的復(fù)雜性也使得尋找一個完美的訓(xùn)練集非常不容易。從大數(shù)據(jù)到AI,除了“有數(shù)”以外,還得鍛煉“庖丁解牛”的精湛技藝與方法體系。目前人工智能在醫(yī)療領(lǐng)域的應(yīng)用尚處于比較淺顯的階段,人工智能可取代醫(yī)生的重復(fù)性體力勞動工作,提升醫(yī)生的職業(yè)專業(yè)程度,但是從更深一步的診斷決策和治療尚有缺陷。
最后,我想引用作者尤瓦爾·赫拉利在《未來簡史》中的兩句話:
?、偃祟愔圆辉敢飧淖儯且驗楹ε挛粗?。但歷史唯一不變的事實,就是一切都會改變。
②全球經(jīng)濟導(dǎo)向已經(jīng)從物質(zhì)經(jīng)濟轉(zhuǎn)變?yōu)橹R經(jīng)濟,過去主要的財富來源是物質(zhì)資產(chǎn),比如金礦、麥田、油井,現(xiàn)在的主要財富來源則是知識。
為此,在可見的未來,我可以大膽地預(yù)測,醫(yī)療大數(shù)據(jù)與醫(yī)學(xué)人工智能將是一場事關(guān)人類健康與生存的知識革命!
同道們,讓我們一起改變,一起投入到這場偉大的人類健康革命中去吧!
-end-
1.用于成人和1歲及1歲以上兒童的甲型和乙型流感治療(磷酸奧司他韋能夠有效治療甲型和乙型流感,但是乙型流感的臨床應(yīng)用數(shù)據(jù)尚不多)。2.用于成人和13歲及13歲以上青少年的甲型和乙型流感的預(yù)防。
健客價: ¥631.用于成人和1歲及1歲以上兒童的甲型和乙型流感治療(磷酸奧司他韋能夠有效治療甲型和乙型流感,但是乙型流感的臨床應(yīng)用數(shù)據(jù)尚不多)。 2.用于成人和13歲及13歲以上青少年的甲型和乙型流感的預(yù)防。
健客價: ¥185數(shù)據(jù)自動對接微信,睡眠監(jiān)測。
健客價: ¥249結(jié)腸癌輔助化療:卡培他濱適用于 Dukes’ C 期、原發(fā)腫瘤根治術(shù)后、適于接受氟嘧啶類藥物單獨治療的結(jié)腸癌患者的單藥輔助治療。其治療的無病生存期(DFS)不亞于 5-氟尿嘧啶和甲酰四氫葉酸聯(lián)合方案(5-FU/LV) 。卡培他濱單藥或與其他藥物聯(lián)合化療均不能延長總生存期(OS),但已有試驗數(shù)據(jù)表明在聯(lián)合化療方案中卡培他濱可較 5-FU/LV 改善無病生存 期。醫(yī)師在開具處方使用卡培他濱單藥對 D
健客價: ¥319本產(chǎn)品廣泛應(yīng)用于家庭保健、運動護理及醫(yī)療臨床等物理降溫,使用方便,能迅速緩解因發(fā)熱、頭痛、眼倦、扭傷等所產(chǎn)生的不適或痛楚。
健客價: ¥18適用于醫(yī)療機構(gòu)臨床輸液時針體及輸液導(dǎo)管固定,傷口敷料固定及其它醫(yī)療用品固定用。
健客價: ¥90用于體外測量人體新鮮毛細血管全血樣本中的葡萄糖濃度,適用于糖尿病患者在家中進行血糖監(jiān)測,也可輔助臨床醫(yī)護人員監(jiān)測患者糖尿病控制的效果。
健客價: ¥558在臨床醫(yī)生指導(dǎo)下,用于便秘患者排便。
健客價: ¥325供臨床醫(yī)務(wù)人員在有創(chuàng)操作過程中佩帶,為接受處理的患者及實施有創(chuàng)操作的醫(yī)務(wù)人員提供防護,阻止血液、體液和飛濺物傳播。
健客價: ¥1該產(chǎn)品主要供臨床人員在給患者控制吸入氧氣時使用,允許消毒后重復(fù)使用。
健客價: ¥70該胰島素注射筆針頭在臨床上與胰島素注射筆配套用于皮下注射胰島素。
健客價: ¥188該胰島素注射筆針頭在臨床上與胰島素注射筆配套用于皮下注射胰島素。
健客價: ¥162該胰島素注射筆針頭在臨床上與胰島素注射筆配套用于皮下注射胰島素。
健客價: ¥18該胰島素注射筆針頭在臨床上與胰島素注射筆配套用于皮下注射胰島素。
健客價: ¥21手機開啟網(wǎng)絡(luò)(移動數(shù)據(jù)或無線網(wǎng)絡(luò)),接聽免費業(yè)務(wù),移動、聯(lián)通、電信用戶均可使用。(本軟件僅適用于智能手機的安卓、蘋果系統(tǒng))
健客價: ¥100癲癇: 對12歲以上兒童及成人的單藥治療: 簡單部分性發(fā)作 復(fù)雜部分性發(fā)作 繼發(fā)性全身強直-陣攣性發(fā)作 原發(fā)性全身強直-陣攣性發(fā)作 目前暫不推薦對12歲以下兒童采用單藥治療,因為尚未得到對這類特殊目標(biāo)人群所進行的對照試驗的相應(yīng)數(shù)據(jù)。 2歲以上兒童及成人的添加療法: 簡單部分性發(fā)作 復(fù)雜部分性發(fā)作 繼發(fā)性全身強直-陣攣性發(fā)作 原發(fā)性全身強直-陣攣性發(fā)作 本品也可用于治療合并有
健客價: ¥49拉莫三嗪片,適應(yīng)癥為癲癇: 對12歲以上兒童及成人的單藥治療: 1. 簡單部分性發(fā)作 2. 復(fù)雜部分性發(fā)作 3. 續(xù)發(fā)性全身強直- 陣攣性發(fā)作 4. 原發(fā)性全身強直- 陣攣性發(fā)作目前暫不推薦對十二歲以下兒童采用單藥治療,因為尚未得到對這類特殊目標(biāo)人群所進行的對照試驗的相應(yīng)數(shù)據(jù)。 兩歲以上兒童及成人的添加療法 ( add-on therapy ) : 1. 簡單部分性發(fā)作 2. 復(fù)雜部
健客價: ¥102該產(chǎn)品與配套的血糖試紙配合使用,用于定量檢測人體毛細血管全血中葡萄糖濃度;可以由臨床單位醫(yī)護人員、熟練掌握該項操作的患有糖尿病的非專業(yè)人員或其家屬操作;只用于監(jiān)測糖尿病人血糖控制的效果,而不能用于糖尿病的診斷和篩查,也不能作為治療藥物調(diào)整的依據(jù)。本品為重復(fù)性使用醫(yī)療器械。
健客價: ¥599適用于痛風(fēng)患者高尿酸血癥的長期治療,不推薦用于無臨床癥狀高尿酸血癥。
健客價: ¥198為了減少抗藥性細菌的形成并確保替硝唑和其他抗菌藥物的有效性,替硝唑用于治療或預(yù)防已被證實或疑似易感病原體導(dǎo)致的感染。 若有培養(yǎng)和敏感性試驗的相關(guān)信息,應(yīng)參考這些信息來選擇或修改抗菌治療方案。若沒有這些信息,當(dāng)?shù)氐牧餍胁W(xué)和細菌敏感性數(shù)據(jù)等經(jīng)驗,可能有助于選擇治療方案。詳見產(chǎn)品說明書。
健客價: ¥5解毒,消腫,止痛。臨床主要用于中、晚期腫瘤的治療,亦可用于慢性乙型肝炎等癥。
健客價: ¥2961.血壓計:用于測量人體血壓及脈搏。2.血糖儀:用于醫(yī)療機構(gòu)快速血糖測試,糖尿病患者或其他人群的血糖監(jiān)測。3.試紙:適用于糖尿病患者血糖自測及糖尿病篩選。4.針頭:適用于臨床需微量采血時刺破皮膚用。
健客價: ¥399是一款可以醫(yī)院家庭兩用型的睡眠檢測儀??蓪崟r檢測人體血氧和鼻氣流信息,對數(shù)據(jù)進行TF卡存儲和上傳電腦功能,病人可以通過網(wǎng)絡(luò)請專家進行病例診斷,滿足于醫(yī)院、社區(qū)、個人等多方面的需要。
健客價: ¥3088ELLA艾拉是一款彰顯魅力的手動按摩棒,她平滑無縫的觸感和流暢的專門外形為情侶或個人而設(shè)計,引導(dǎo)他們探尋內(nèi)心深處的幻想。誘人的雙端設(shè)計替代傳統(tǒng)震動器,精準(zhǔn)的塑形意在加強點刺激或更傳統(tǒng)的性交方式。
健客價: ¥380