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16SrRNA高通量測(cè)序研究有齲者唾液微生物群落結(jié)構(gòu)及多樣性

2016-03-17 來(lái)源:健客網(wǎng)社區(qū)  標(biāo)簽: 掌上醫(yī)生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護(hù)膚
摘要:研究指出,人類口腔唾液有復(fù)雜的微生物群落結(jié)構(gòu);在門水平和屬水平上,有齲者的微生物種類較無(wú)齲者稍有減少;Firmicutes和SR1菌門,Rothia、Alistipes和Catonella菌屬的存在與齲病呈負(fù)相關(guān);相反地,Scardovia等菌屬的存在與齲病呈正相關(guān)。

  近期,蘭州大學(xué)口腔醫(yī)學(xué)院修復(fù)科研究人員發(fā)表論文,旨在通過(guò)16SrRNA高通量測(cè)序研究有齲和無(wú)齲者唾液的微生物群落結(jié)構(gòu)及其差異。研究指出,人類口腔唾液有復(fù)雜的微生物群落結(jié)構(gòu);在門水平和屬水平上,有齲者的微生物種類較無(wú)齲者稍有減少;Firmicutes和SR1菌門,Rothia、Alistipes和Catonella菌屬的存在與齲病呈負(fù)相關(guān);相反地,Scardovia等菌屬的存在與齲病呈正相關(guān)。該文發(fā)表在2015年第05期《口腔醫(yī)學(xué)研究》雜志上。

  在甘肅省康樂(lè)縣景古鎮(zhèn)居民口腔檢查中隨機(jī)選取14位漢族居民,其中,7例有齲(caries-active,CA組,DMFT≥4)、7例無(wú)齲(caries-free,CF組)。采取唾液樣本,提DNA,PCR擴(kuò)增,利用IlluminaMiseq測(cè)序平臺(tái)對(duì)16SrRNAV4區(qū)進(jìn)行雙端測(cè)序;利用Mothur、MEGAN4、Cluster3.0和JavaTreeview等軟件進(jìn)行細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性的差異分析。

  共得到118151條優(yōu)質(zhì)序列,發(fā)現(xiàn)5738個(gè)OTUs,2795個(gè)物種,歸屬27個(gè)門,218個(gè)屬。CA組和CF組唾液微生物群落結(jié)構(gòu)有差異,其中,門水平上,F(xiàn)irmicutes和SR1在CA組顯著低于CF組(P<0.05)。屬水平上,Rothia、Alistipes和Catonella在CA組顯著低于CF組(P<0.05),Scardovia在CA組顯著高于CF組(P<0.05);CA組和CF組OTUs分別為(550.2&plusmn;26.48),(597.4±66.07),CA組和CF組Simpson多樣性指數(shù)分別為(0.73±0.03),(0.49±0.01),均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。

 

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