海綿腎如無并發(fā)癥如感染、出血、結(jié)石等產(chǎn)生，可無特殊臨床癥狀。根據(jù)臨床和放射學(xué)上的改變，將病人的初期癥狀分為3類：臨床上沒有癥狀或僅有輕微癥狀，在排泄性尿路造影片上只表現(xiàn)有特征性改變，但尿路平片上沒有鈣化現(xiàn)象;在尿路平片上呈現(xiàn)鈣質(zhì)沉著，病人表現(xiàn)為尿路感染。這種鈣質(zhì)沉著應(yīng)與原發(fā)性甲狀旁腺機(jī)能亢進(jìn)及腎小管酸中毒等相區(qū)別;由于慢性炎癥，腎小管結(jié)石破出錐體進(jìn)入腎盞和腎盂，產(chǎn)生結(jié)石的典型癥狀。

　　1.血尿 這是最常見的癥狀，約占85%，而且反復(fù)發(fā)作。發(fā)作時(shí)可伴有腰痛或同時(shí)排出細(xì)砂樣結(jié)石。一般為鏡下血尿，也可見到個(gè)別病例表現(xiàn)為無痛性肉眼全程血尿。

　　2.腎絞痛 可為早期癥狀，常多次發(fā)作，約占50%，為結(jié)石排出時(shí)的伴隨癥狀，結(jié)石排出后癥狀緩解。少數(shù)病例，結(jié)石在腎盂內(nèi)逐漸長大，或嵌頓在輸尿管中，需要手術(shù)或碎石處理。

　　3.腎盂腎炎 約有50%病人以腎盂腎炎發(fā)病，即錐體內(nèi)乳頭管、集合管及擴(kuò)張的囊腔內(nèi)發(fā)生感染，波及整個(gè)尿路，嚴(yán)重者可蔓延到囊腔周圍的腎臟組織而影響腎功能。

　　4.全身癥狀 病程后期可造成腎功能損害，尤其是腎小管功能的損害，可引起全身癥狀，如貧血、高血壓、水腫、水電解質(zhì)紊亂及酸堿平衡失調(diào)。