VKC應(yīng)與其他變應(yīng)性結(jié)膜病相鑒別。嚴(yán)重的VKC患者具有典型的體征：瞼結(jié)膜鋪路石樣乳頭增生、盾形潰瘍、Horner-Trantas點(diǎn)以及其他征象。然而對(duì)于輕型病例確診比較困難常需要借助實(shí)驗(yàn)室檢查。

　　1.特應(yīng)性角結(jié)膜炎(AKC) 在早期，兩種疾病常易發(fā)生混淆。在流行病學(xué)上，AKC多發(fā)于十幾歲到中年;多為常年性，比VKC病程長(zhǎng)。從外部觀察，AKC患者的眼瞼常有慢性眼瞼炎和濕疹。同VKC不同AKC常引起結(jié)膜瘢痕、上皮下浸潤(rùn)和下穹隆縮窄。其他的癥狀和體征也有助于兩者之間的鑒別：AKC主要影響下瞼結(jié)膜，有小乳頭;AKC的角膜新生血管化通常位于深層;AKC的分泌物多為水樣，而VKC的分泌物多為黏稠性;在AKC很難發(fā)現(xiàn)有Homer-Trantas點(diǎn);AKC的結(jié)膜刮片很少發(fā)現(xiàn)有嗜酸性顆粒。

　　2.枯草熱性結(jié)膜炎：又稱季節(jié)變應(yīng)性結(jié)膜炎(seasonal allergic conjunctivitis，SAC)，是臨床常見的疾病。與抗原接觸后迅速發(fā)病主要表現(xiàn)為結(jié)膜充血、結(jié)膜水腫和偶發(fā)眼瞼水腫。與VKC不同，SAC患者常伴有變應(yīng)性鼻炎或鼻竇炎(sinusitis)在SAC很難觀察到角膜的改變。

　　3.巨乳頭結(jié)膜炎：主要與配戴接觸鏡有關(guān)，其他的刺激因素還有配戴義眼埋藏縫線暴露。其上瞼結(jié)膜的乳頭反應(yīng)和黏液的產(chǎn)生非常類似VKC。當(dāng)去除刺激因素后，GPC的癥狀和體征將明顯減輕或消失。通過(guò)病史分析和仔細(xì)檢查可以進(jìn)行鑒別診斷。

　　4.接觸性結(jié)膜炎：因使用藥物誘發(fā)超敏反應(yīng)而造成的化學(xué)性(或毒性)結(jié)膜炎也可產(chǎn)生類似VKC的癥狀和體征。引起藥物超敏反應(yīng)的主要藥物有：阿托品、局部麻醉藥、抗生素、苯腎上腺素和其他藥物載體?；瘜W(xué)性結(jié)膜炎的乳頭反應(yīng)并不劇烈，下穹隆結(jié)膜易受累。

　　5.沙眼：沙眼也可引起上瞼結(jié)膜和角鞏膜緣上方的病理改變?nèi)欢cVKC不同，沙眼可以引起結(jié)膜瘢痕、濾泡性結(jié)膜炎和Arlt線(水平方向的上皮下纖維化)。結(jié)膜刮片無(wú)嗜酸性粒細(xì)胞存在。然而，VKC有時(shí)和沙眼同時(shí)存在。