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DNA甲基化標志物:預測胃癌

摘要:特殊標志物,比如ELMO1在兩個患者組都表現(xiàn)出高識別率。然而,其它標記,包括ARHGEF4,由于橫跨正常組和患者組的背景,識別率更具多樣。

美國胃腸病學院提交的一項研究新研究表明,在美國和韓國的隊列中,多個甲基化DNA標志物可以準確地預測胃癌。

“在這項研究中,我們通過全甲基化測序鑒定了新的甲基化DNA標志物,隨后在美國和南韓的患者隊列中確認了最佳候選,”Bradley W.Anderson博士(梅奧診所)在演講中提到。

來自美國35名患者和韓國50名患者的17份甲基化DNA標志物候選具有完整的腺癌,Anderson和同事們對其進行了評估,并與對照組進行比較。美國組是與65名健康患者的正常胃黏膜上皮細胞對比。50名韓國患者在首爾大學醫(yī)院接受治療,作為自身對照組。據(jù)Anderson所說,在基線時取鄰近的正常粘膜做樣本。

對每一個標記物,應用邏輯回歸分析計算曲線下面積(AUC)。來自顯微組織的DNA是通過甲基化特異性聚合酶鏈式反應進行分析,通過β肌動蛋白對標志物水平標準化。

研究人員發(fā)現(xiàn),前10位的DNA標記包括ARHGEF4,ELMO1,ABCB1,CLEC11A,ST8SIA1,SFMBT2,CD1D,CYP26C1,ZNF569和C13ORF18。

這10個標志物檢測出美國組胃癌率為100%,南韓檢測率為94%,其特異性為95%。

美國隊列各標志物的AUCs分別為ARHGEF4:0.92;ELMO1:0.91;ABCB1:0.89;CLEC11A:0.88;ST8SIA1:0.85;SFMBT2:0.82;CD1D:0.82;CYP26C1:0.81;ZNF569:0.75;C13ORF18:0.66。

南韓隊列各標記的AUCs分別為ARHGEF4:0.73;ELMO1:0.9;ABCB1:0.78;CLEC11A:0.75;ST8SIA1:0.8;SFMBT2:0.94;CD1D:0.87;CYP26C1:0.79;ZNF569:0.75;C13ORF18:0.79。

“這些標志物準確性高,而且一些標記在兩組的判別中相似,”Anderson說。

特殊標志物,比如ELMO1在兩個患者組都表現(xiàn)出高識別率。然而,其它標記,包括ARHGEF4,由于橫跨正常組和患者組的背景,識別率更具多樣。

“在美國組和南韓組中,研究人員鑒定出對胃癌具有高敏感性和特異性的有益甲基化DNA標志物,Anderson總結(jié)說。“將這些候選甲基化DNA標志物批準用于早期胃癌,還需要進一步研究。”

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