“出芽”

　　UChicago科學家模擬HIVGag蛋白參與了強迫受害者的細胞使用膠囊HIV感染其他細胞，這一過程稱為“出芽”。

　　計算機建模幫助了一個來自芝加哥大學的科學家團隊，破譯了先前未知的關于艾滋病病毒迫使細胞將病毒傳播到其他細胞的過程的細節(jié)。11月7日出版的《美國國家科學院院刊》(inProceedingsofTheNationalAcademyofSciences)上發(fā)表的這一研究結果可能為對抗病毒提供了一條新的途徑。

　　艾滋病毒成功的一個關鍵部分是一個骯臟的小技巧，在體內繁殖。一旦艾滋病毒感染了細胞，它就會迫使細胞從自己的膜中制造出一個小膠囊，里面充滿了病毒。“膠囊”——一個被稱為“出芽”的過程——漂浮到血液中去感染更多的細胞。一旦進入另一個不知情的細胞內，膠囊結構就會破裂，而艾滋病毒RNA就可以工作了。

　　科學家們知道，發(fā)芽的過程中含有一種叫做Gag蛋白的HIV蛋白復合物，但分子過程的細節(jié)卻很模糊。“一段時間以來，我們已經了解到最終的組裝結構是什么樣子的，但在這兩者之間的所有細節(jié)基本上都是未知的，”格雷戈里·沃斯(GregoryVoth)說，他是Haigp.Papazian杰出的化學教授，也是該論文的通訊作者。

　　由于很難用成像技術獲得蛋白質復合體的一個良好的分子水平快照，Voth和他的團隊建立了一個計算機模型來模擬Gag蛋白的行動。通過模擬，他們可以對模型進行調整，直到他們找到最可能的分子過程的結構，然后由美國國立衛(wèi)生研究院的Jenniferlippincott-schwartz研究所和霍華德·休斯醫(yī)學研究所Janelia研究校區(qū)進行實驗驗證。

　　他們建立了一個缺失部分的Gag蛋白復合體的模型，并對其進行了調整，直到他們能夠看到蛋白質如何通過利用細胞基礎設施來為萌芽的過程做準備。

　　Voth說：“這真的證明了現代計算機模擬病毒的力量。”

　　“一旦你有了一個致命的弱點，你就可以制造一種藥物來阻止Gag蛋白的積累，并希望能阻止病毒的發(fā)展。”

　　他說，研究小組計劃下一步研究HIV病毒膠囊中的Gag蛋白的結構。