(一)治療
本病常在免疫功能降低時(shí)發(fā)病，故應(yīng)消除各種誘發(fā)因素。早期局限性肺部肉芽腫或空間，可采用抗真菌藥物治療，必要時(shí)可手術(shù)切除。
對(duì)于單純有呼吸道隱球菌寄生的慢阻肺病人，當(dāng)沒有肺部受侵犯的證據(jù)時(shí)應(yīng)定期隨訪。對(duì)胸片有肺實(shí)質(zhì)受侵犯，呼吸道分泌物培養(yǎng)中分離出新型隱球菌的病人應(yīng)給予積極的治療，防止發(fā)生血源性播散。對(duì)于免疫功能低下的病人因病變極易由肺播散到中樞神經(jīng)系統(tǒng)所以既使其腦脊液檢查還是陰性結(jié)果，亦應(yīng)極早開始系統(tǒng)治療。
治療中以兩性霉素B作為首選藥物，單用兩性霉素B時(shí)從小劑量開始每天0.1～0.25mg/kg，逐漸增加至每天1mg/kg，加入5%葡萄糖液中，滴注時(shí)間不少于6～8h，一個(gè)療程總劑量為1～2g。
國外學(xué)者統(tǒng)計(jì)在艾滋病病人中有7%的人并發(fā)新型隱球菌的感染，在治療中多采用積極的抗真菌治療。選擇兩性霉素B和氟胞嘧啶(5-氟胞嘧啶)的聯(lián)合應(yīng)用。兩性霉素B：0.3mg/(kg·d)，氟胞嘧啶(5-氟胞嘧啶)100mg/(kg·d)(分四次口服)。平均4～6周即可見到臨床效果。對(duì)于兩性霉素B的肝、腎毒性及可能引發(fā)的血管炎，氟胞嘧啶(5-氟胞嘧啶)引起的骨髓抑制和腹瀉造成的電解質(zhì)紊亂，應(yīng)給予認(rèn)真的監(jiān)測(cè)。出現(xiàn)毒副反應(yīng)的病人應(yīng)被減少藥物劑量。對(duì)于不能耐受兩性霉素B和氟胞嘧啶(5-氟胞嘧啶)的病人，推薦選用靜脈滴注氟康唑(大扶康)，首日劑量400mg，以后每天200mg。其可有效的進(jìn)入腦脊液。
對(duì)臨床癥狀較輕而有隱球菌感染證據(jù)的病人可以采用口服氟康唑或伊曲康唑。因伊曲康唑在腦脊液內(nèi)濃度較低，一般作為維持治療，每天400mg用藥1～47個(gè)月(平均12個(gè)月)，復(fù)發(fā)率為13%。用藥時(shí)間長短取決于隱球菌培養(yǎng)及血清莢膜多糖抗原的陰轉(zhuǎn)情況。
單一肺部結(jié)節(jié)病灶的隱球菌感染，是否行外科手術(shù)切除目前還有爭議。多數(shù)意見贊成抗真菌藥物治療，因?yàn)槌松贁?shù)單一結(jié)節(jié)外科手術(shù)治療有效，多數(shù)病例不可能完全切除肺部隱球菌結(jié)節(jié)或團(tuán)塊以控制感染。個(gè)別病人因胸膜滲出需作引流。其余絕大多數(shù)病人藥物治療就可以達(dá)到治療目的。
(二)預(yù)后
該病原菌主要侵犯中樞神經(jīng)，對(duì)腦膜和腦組織有親和性，故腦隱球菌病80%以上，死亡率最高。