對(duì)深部厭氧菌感染的治療應(yīng)包括膿液引流和外科手術(shù)切除失活組織?？股嘏浜贤饪剖中g(shù)有助于控制菌血癥，減少繼發(fā)性或遷徙性化膿并發(fā)癥，并能防止手術(shù)部位周圍的感染局部擴(kuò)散。
因?yàn)閰捬蹙囵B(yǎng)的結(jié)果可能要等待3~5日，通常應(yīng)在明確化驗(yàn)結(jié)果之前開(kāi)始抗生素治療。有時(shí)即使混合感染中某些菌株對(duì)抗生素耐藥，抗菌療法也仍可見(jiàn)效，特別當(dāng)給予充分引流時(shí)，效果更好。處理混合感染中的厭氧菌可減少傷口中細(xì)菌的數(shù)量，也可減少膿腫形成的數(shù)量。膿腫或容易感染的部位，如穿孔的器官必須關(guān)閉或引流。失活的組織，異物和壞死組織必須清除。任何封閉腔隙的感染如膿胸必須引流。若可能，應(yīng)重建血液供應(yīng)的循環(huán)。對(duì)膿毒性血栓性靜脈炎需結(jié)扎靜脈并給抗菌治療。
口咽部厭氧菌感染應(yīng)該用青霉素G治療。在很少情況下，口腔厭氧菌感染對(duì)青霉素反應(yīng)差，則應(yīng)選用對(duì)耐青霉素厭氧菌有效的藥物（見(jiàn)下文）。肺膿腫應(yīng)該用克林霉素或β-內(nèi)酰胺/β-內(nèi)酰胺酶聯(lián)合應(yīng)用。對(duì)青霉素過(guò)敏的病人可用克林霉素或甲硝唑（加用一種對(duì)厭氧菌有效的藥物）。
胃腸道或女性盆腔厭氧菌感染可能含有脆弱擬桿菌，對(duì)青霉素可能有耐藥性。此外還發(fā)現(xiàn)對(duì)第2代頭孢菌素和克林霉素也有耐藥性。沒(méi)有哪種單一療法可顯示其優(yōu)越性。下列藥物在體外試驗(yàn)中表明十分有效：甲硝唑，亞胺培南/西拉司丁，哌拉西林/他唑巴克坦，氨芐青霉素/舒巴坦，美羅匹寧和替卡西林/克拉維酸。有些在體外試驗(yàn)中無(wú)明顯作用但實(shí)際通常有效的藥物有克林霉素，頭孢西丁和頭孢替旦。甲硝唑500~750mg每8小時(shí)靜脈注射1次（兒童：每日30mg/kg分3劑給）與氨基糖苷類（如慶大霉素每日5mg/kg分3劑給）合用，用于治療腹腔內(nèi)感染或任何結(jié)腸源性感染，可覆蓋腸革蘭氏陰性菌群。應(yīng)監(jiān)測(cè)慶大霉素在血清中的濃度，因?yàn)樵撍幱袧撛谛阅I臟毒性和耳毒性。在本治療方案中也可用克林霉素替代甲硝唑，劑量為每8小時(shí)靜脈注射900mg（兒童：每日30mg/kg分3劑給）。甲硝唑是唯一的厭氧菌殺菌劑，對(duì)耐克林霉素的脆弱擬桿菌有效，并可避免克林霉素相關(guān)性偽膜性結(jié)腸炎。有關(guān)該藥潛在的致突變作用尚未見(jiàn)臨床后果。頭孢西丁和頭孢替旦對(duì)厭氧菌有廣泛的抗菌覆蓋面。甲硝唑，亞胺培南，美羅匹寧和β-內(nèi)酰胺/β-內(nèi)酰胺酶聯(lián)合應(yīng)用，在體外試驗(yàn)均顯示最好的抗菌作用。除甲硝唑外，所有這些藥物均可單獨(dú)使用，因?yàn)樗鼈円灿辛己玫目剐柩蹙淖饔谩?/p>