以生殖道衣原體感染為例：
1.生殖道衣原體感染的診斷需要依靠性接觸史、臨床表現(xiàn)和化驗(yàn)檢查結(jié)果。當(dāng)有典型的尿道炎、宮頸炎癥狀時(shí)，診斷不難。但由于無癥狀感染多見，化驗(yàn)檢查顯得十分重要。
2.通過化驗(yàn)可以確定病因，從而針對病因進(jìn)行治療，并有助于對病人的性伴作治療以防止進(jìn)一步傳播;還可發(fā)現(xiàn)無癥狀感染者，有助于消除傳染源;在女病人中檢查并治療衣原體感染將能防止異位妊娠或不育的發(fā)生。
3.診斷沙眼衣原體感染的化驗(yàn)檢查方法包括標(biāo)本涂片染色顯微鏡檢查、衣原體培養(yǎng)法、衣原體抗原檢測、DNA檢測及PCR檢測。涂片檢查是一種簡便、價(jià)廉的診斷方法，可用于新生兒眼結(jié)膜刮片的檢查，但它不適宜用于生殖道沙眼衣原體感染的診斷，因?yàn)樵谶@種情況下，它的敏感性和特異性均極低。
4.衣原體培養(yǎng)是目前檢測沙眼衣原體感染最為敏感和特異的方法，敏感性為70%～95%，可用作確證試驗(yàn)和治療后的判愈試驗(yàn)，但實(shí)驗(yàn)室條件要求高，價(jià)格昂貴。抗原檢測法診斷沙眼衣原體感染的敏感性為70%～90%，特異性為83%～99%，快速，價(jià)廉，操作簡便，但對于實(shí)驗(yàn)人員的技術(shù)水平要求較高。PCR診斷生殖道沙眼衣原體感染的敏感性高于培養(yǎng)法，特異性可達(dá)99%～100%，但檢測條件和操作人員的水平要求高，容易導(dǎo)致出現(xiàn)假陽性結(jié)果，僅適合在高級別醫(yī)院或機(jī)構(gòu)開展。
5.此外，在性病性淋巴腫和沙眼衣原體性附睪炎、輸卵管炎時(shí)，檢測血清抗體水平有助于診斷。值得注意的是，目前在各種形形色色的性病診所或機(jī)構(gòu)中盛行的多媒體顯微儀(MDI)檢查，其可靠性沒有得到科學(xué)的證明，其應(yīng)用也未得到國家衛(wèi)生機(jī)構(gòu)的批準(zhǔn)。

 1、需與慢性前列腺炎相鑒別
慢性前列腺炎是一種可導(dǎo)致精液正常成分和理化性質(zhì)改變的疾病，進(jìn)而影響精子的活力和存活能力，使男性的生育能力受到一定影響，需與男性不育疾病認(rèn)真鑒別，只要積極治療，是完全可以徹底康復(fù)的。
2、與精囊炎相鑒別
精囊炎患者大多伴有結(jié)核性疾病，如結(jié)核性附睪炎或結(jié)核性前列腺炎，常會(huì)表現(xiàn)出性交射精后明顯的下腹部或陰部疼痛腫脹等癥狀，實(shí)驗(yàn)室檢查可發(fā)現(xiàn)精液中果糖濃度異?；虬准?xì)胞數(shù)量增多等指標(biāo)，需與男性不育相區(qū)別，以防因誤診而耽誤疾病早期最佳治療時(shí)機(jī)。
3、與生殖道感染相鑒別
生殖道感染主要是由于生殖道組織炎性增生導(dǎo)致的輸精管壁增厚以及管腔纖維化狹窄，進(jìn)而引發(fā)精子無法正常排出或造成精子活力下降等不良后果，需與男性不育性疾病認(rèn)真鑒別，并積極治療感染，以防止病情遷延而影響男性生育功能。