(一)臨床癥狀
1、非淋菌性尿道炎潛伏期為10-20天。
2、起病不如淋病急，癥狀拖延，時輕時重，但比淋病輕。約50%的病人有尿痛、尿道癢等癥狀。初診時很易被漏診。男性非淋菌性尿道炎表現(xiàn)為尿道不適、發(fā)癢、燒灼感或刺疼，尿道紅腫，尿道分泌物多為漿液狀、稀薄、晨起有“糊口”現(xiàn)象。女性非淋菌性尿道炎表現(xiàn)為宮頸的炎癥和糜爛、分泌物增多，宮頸分泌物中有多數(shù)分葉型白細胞(高倍鏡下每視野超過10個)，陰道及外陰瘙癢，下腹不適感。注意：有些病人可無癥狀或癥狀不典型，易被漏診。宮頸分泌物中有多數(shù)分葉型白細胞(高倍鏡下每視野超過10個)。
3、尿道分泌物少，稀薄，粘液性或粘膜膿性。較長時間不排尿(如晨起)尿道外口可溢出少量稀薄分泌物。有時僅表現(xiàn)為晨起痂膜封住尿道口或污染內(nèi)褲。檢查時，需由后向前按擠前尿道才可能有少許分泌物由尿道口溢出。有時病人有癥狀無分泌物，也可無癥狀而有分泌物。
4、常與淋病同時感染。前者先出現(xiàn)淋病癥狀，經(jīng)抗淋病治療后，淋球菌被青霉素殺死，而衣原體、支原體依然存在。在感染1-3周后發(fā)病。臨床上很易被誤認為淋病未治愈或復發(fā)。
5、處理不當或治療不及時可引起并發(fā)癥(1%)。如急性附睪炎、前列腺炎、結腸炎、咽炎。女性宮頸炎、宮頸糜爛、前庭大腺炎、陰道炎、輸卵管炎、盆腔炎、異位妊娠、不育等。
6、新生兒通過感染的產(chǎn)道、生后3-13d可發(fā)生眼結膜炎，眼部有粘液膿性分泌物，也可無分泌物。但多不侵犯角膜。下生后2-3周可發(fā)生肺炎。癥狀不斷加重，呼吸急促為其特點，但不發(fā)熱。其中半數(shù)患兒有眼結膜炎。
7、極少數(shù)病人可伴發(fā)Reifer綜合征：尿道炎、關節(jié)炎、角膜炎、結合膜炎及皮疹。
(二)診斷
1、不潔性交史、潛伏期及癥狀。
2、尿道分泌物涂片及培養(yǎng)排除淋球菌、念珠菌及其他細菌感染。涂片有大量白細胞，10-15個以上/400倍，5個以上/1000倍顯微鏡檢。
3、尿道分泌物或宮頸刮片，單克隆衣原體熒光抗體檢查或培養(yǎng)。標本取法：男性2h以上不排尿，棉拭子插入尿道2-4cm，輕輕旋轉5s，放置2-3s，然后取出培養(yǎng)。女性用窺陰器充分露暴宮頸，第一根拭子將宮頸表面分泌物擦掉，第二根拭子插入宮頸1-2cm，旋轉10s，停2-3s，取出拭子，不要碰陰道壁。

本病主要應與淋菌性尿道炎相鑒別，后者潛伏期較短，平均3天～5天，尿痛比較嚴重，分泌物多為膿性，量多，淋球菌檢查陽性，而NGU的分泌物多為漿液性或粘液膿性，較稀薄，量少。查不出淋球菌。
非淋菌性尿道炎和淋病有何不同
(1)病原體不同。非淋菌性尿道炎的病原體是沙眼衣原體和支原體、白色念珠菌、陰道毛滴蟲等，而淋病的病原體是淋病雙球菌。
(2)臨床癥狀不同。非淋菌性尿道炎的臨床癥狀是分泌物呈乳白色，以慢性尿道炎的形式表現(xiàn)出來;而淋病的開始癥狀是自尿道口流出大量黃色膿性分泌物，以急性尿道炎的形式表現(xiàn)出來。