狹顱癥常合并身體其他部位的畸形，最常見者為對稱性并指/趾畸形，以及唇裂、腭裂、面骨畸形、鼻骨塌陷、脊柱裂、蝶骨小翼過度生長、后鼻孔閉鎖及鼻咽腔梗阻、硬腭增高，先天性心臟病及外生殖器異常等。
狹顱癥手術(shù)治療的并發(fā)癥可分術(shù)中及術(shù)后并發(fā)癥兩類：
1.術(shù)中并發(fā)癥
(1)靜脈竇破裂出血：發(fā)生率為5.1%，常為上矢狀竇(1.9%)、橫竇(1.3%)和顱骨板障靜脈竇(1.9%)。上矢狀竇破裂可引起大量失血而發(fā)生循環(huán)系統(tǒng)功能障礙。若能很快復(fù)蘇成功，可不留任何后遺癥。靜脈竇破裂常因剝離硬腦膜或分離骨瓣時撕裂所致?？勺鲉渭兛p合修補術(shù)。若為顱骨板障靜脈出血，可用骨蠟填塞止血。
(2)硬腦膜損傷：絕大多數(shù)為硬腦膜小裂傷，為顱骨內(nèi)板骨嵴插入硬腦膜所致，發(fā)生率為70%，可做縫合修補。硬腦膜大裂傷少見，4%需要作骨膜貼補縫合。
(3)硬膜下血腫：發(fā)生率為1.3%，為術(shù)中剝離硬膜時皮質(zhì)硬腦膜靜脈破裂出血所致。常為額葉前片狀小血腫，可經(jīng)硬腦膜開孔排除血腫。
(4)腦水腫：為通氣障礙造成，常影響顱底的暴露。解除通氣障礙后，腦水腫即消失。一般不留術(shù)后后遺癥。
2.術(shù)后并發(fā)癥
(1)硬腦膜外血腫：發(fā)生率為1.9%，其臨床表現(xiàn)不典型，很難做出診斷;因此，術(shù)后早期有異常癥狀和體征者，應(yīng)毫不猶豫地行CT掃描。
(2)復(fù)蘇失敗：在整個手術(shù)過程中可能持續(xù)失血。如手術(shù)中發(fā)生大出血，對嬰兒來說是致命的，常發(fā)生呼吸困難、急性肺水腫而死亡。其發(fā)生率為1.3%。
(3)感染：術(shù)后感染包括切口感染、腦膜炎及骨髓炎等。切口感染表現(xiàn)為切口紅腫，無發(fā)熱，一般情況多無大的變化，經(jīng)局部處理及全身用藥，一般可以控制。若形成骨髓炎，局部引流沖洗無效時，須全部切除感染的骨瓣。個別患者可能發(fā)生腦膜炎，常常危及生命。
(4)腦脊液鼻漏：發(fā)生率為1.9%，常發(fā)生在顱面狹窄癥術(shù)后，常并發(fā)腦膜炎，可經(jīng)腰穿蛛網(wǎng)膜下腔引流減壓治愈。
(5)頭皮張力過高：頭皮張力過高可致切口裂開或頭皮壞死，這種情況罕見，頭皮張力過高亦可使骨瓣移位。廣泛游離頭皮可以減輕其縫合的張力。
(6)骨瓣吸收：骨瓣吸收是罕見的，發(fā)生率為0.7%，但這是顱骨骨瓣成形術(shù)中最令人擔心的并發(fā)癥之一。一旦骨瓣吸收，勢必導(dǎo)致手術(shù)失敗。
(7)術(shù)后癲癇、視力和動眼神經(jīng)障礙：均為罕見。